聯邦政府的外國影響力透明計劃面臨著初期的考驗。中國政府出資和管理的孔子學院已成為這個新的問責制度的重點，但大學們無視壓力，拒絕將孔子學院註冊為外國代理人。

據悉尼晨鋒報報道，在被警告他們可能受制於新計劃後，全澳13所開辦孔子學院的大學沒有一個將其「文化語言中心「註冊，以其行為向政府表明了立場。政府可以使用新法所賦予的權力調查這些」中心『，並強制註冊。

孔子學院由大學和漢辦合資開辦，漢辦是一個中國政府機構，負責提供資金、人員和其他支持。批評者擔心中國政府對敏感問題的審查及對東道主大產生學更廣泛的影響。

透明計劃是澳大利亞政府打擊外國干涉和影響的措施之一。政府消息來源和獨立專家稱告訴悉尼晨鋒報和時代報，孔子學院顯而易見是該計劃的首要針對對象。

悉尼大學，墨爾本大學，格里菲斯大學，昆士蘭科技大學，查爾斯達爾文大學和紐卡斯爾大學的代表表示，它們的孔子學院已經考慮了這項立法，並認為它們目前不需要註冊。

西澳大學的發言人表示，它將遵守該法案，但「到目前為止，西澳大學孔子學院尚未提交任何需要註冊的材料。「

昆士蘭大學的一位發言人表示，該大學「正在繼續採取措施確保符合要求」。

墨爾本皇家理工大學表示，「目前正在更好地理解」該計劃，而新南威爾士大學表示，它一直遵守所有法律義務。

維多利亞大學，拉籌伯大學和阿德萊德大學拒絕發表評論。

大學的抵制將孔子學院推到了風口浪尖上，成為新外國影響力法牛刀初試的對象。

外國影響力透明計劃旨在公開記錄代表外國勢力的實體，在澳大利亞試圖施加影響合法活動。註冊的寬限期已於3月10日結束。

由於大學和其他組織的強烈反對，去年政府修改了該法的限制範圍。這些變化使大學的義務變得寬鬆。

當被問及大學的反應時，司法部長Christian Porter表示，註冊最初給那些實體選擇選擇的機會，之後政府將採取一系列行動。現在寬限期已經結束，一些組織已在政府的考量之中。

司法部室秘書可以先要求各組織提供進一步的資料。如果認為大學應該註冊，將向它們發出強制性透明度註冊通知。如不遵守法律會面臨嚴厲的處罰。

由於政府和學術界日益加深的擔憂，國際上的一些大學關閉了孔子學院。新南威爾士州教育部目前正在審查其與漢辦的「孔子課堂」協議。

最近美國參議院在一份報告中建議美國司法部，調查孔子學院是否應按「外國代理人註冊法」進行註冊，這項美國法律是澳大利亞外國影響力法框架的參照。

其它一些大學已經根據外國影響力計劃自願註冊，西澳大學的珀斯美國亞洲中心和悉尼大學的美國研究中心均公開了與外國政府的關係。